Хотя по сравнению с обычными лекарствами препараты из лекарственных растений содержат действующие вещества в меньших концентрациях, все же к их приему нужно относиться осторожно и внимательно. Помните, что и растения могут иметь противопоказания к применению и оказать побочное действие или даже причинить вред.
Ниже перечислены некоторые из таких противопоказаний.
Аир болотный (корневище) – противопоказан при повышенной секреторной функции желудка.
Аралия манчжурская – не рекомендуется при повышенной нервной возбудимости, бессоннице, гипертонии (повышенном давлении).
Арония (рябина черноплодная) – противопоказана при гипотонии (пониженном давлении), повышенной свертываемости крови, язвенной болезни.
Береза (почки) – содержащиеся в почках смолистые вещества могут раздражать почечную ткань. Листья таким побочным действием не обладают.
Горец птичий (спорыш) – не рекомендуется при остром воспалении почек и мочевого пузыря, а также при тромбофлебите, поскольку обладает кровесвертывающим действием.
Девясил – противопоказан при беременности, заболеваниях почек.
Донник лекарственный – может вызывать головную боль, головокружение, тошноту при длительном употреблении.
Душица обыкновенная – не применять при беременности.
Зверобой – не применяется при высоком давлении и температуре. Длительное применение может привести к снижению потенции у мужчин.
Земляника лесная (ягоды) – может вызывать кожную аллергию. Не употребляется при гастрите и язвенной болезни, с осторожностью – при повышенной кислотности желудка.
Золотой корень – не рекомендуется при гипертонии и повышенной температуре.
Калина обыкновенная – нежедателен длительный прием. Не применяется при подагре.
Клюква болотная – противопоказана при обострении язвенной болезни желудка.
Лук репчатый – противопоказан при острых заболеваниях желудка, при патологии печени, почек.
Малина обыкновенная (ягоды) – нельзя употреблять при мочекаменной болезни и подагре.
Мелисса лекарственная (как и мята перечная) – противопоказана при гипотонии.
Можжевельник обыкновенный – не рекомендован при острых заболеваниях почек, при водянке.
Морковь посевная – не употреблять части корнеплодов, находившихся над поверхностью земли и имеющих зеленоватый цвет.
Петрушка огородная – не назначается при беременности. При воспалительных процессах в мочевом пузыре или почках может применяться только в сборах.
Подорожник – не рекомендуется при гастритах с повышенной кислотностью.
Тимьян ползучий (чабрец) – противопоказан при болезнях желудка, почек, печени, атеросклерозе сосудов.
Хвощ полевой – с осторожностью принимать отвары при воспалительных заболеваниях почек.
Хрен обыкновенный – не применяется при хронических и острых воспалительных процессах системы пищеварения.
Чеснок – нежелательно применение при воспалении почек, обострении заболеваний желудка и кишечника.
Шалфей лекарственный – противопоказан при остром воспалительном процессе в почках.
Щавель кислый – не применяется при болезнях почек и подагре.
Элеутерококк – не применяют при гипертонии.
Яблоня лесная (плоды) – противопоказания: повышенная кислотность 
желудка, обострение язвенной болезни.